我们参与开发的多层次生理建模平台 PhysioDesigner 在冲绳科学技术大学院大学和大阪大学的新学术领域 “综合多层次生物功能科学的建立和应用 “中展出。展览由冲绳科学技术大学院大学和大阪大学主办。

PhysioDesigner 在冲绳科学技术研究所(OIST)和大阪大学的两个展位上展出。PhysioDesigner 在冲绳科学技术大学院大学和大阪大学新学术场的两个展位上展出。

在新学术区,展示了从分子水平到心脏电活动水平的实验和计算成果,尤其是 PhysioDesigner 占据了大部分展示空间。 在冲绳科学技术研究所,作为开放生物学单元的代表,展示了约 50 个单元中 4 个单元的成果,其中包括 PhysioDesigner、Flint K3、对接模拟系统、iPathways+ 和 iPathways+ 作为其研发成果。PhysioDesigner 是此次展览的重点。Flint K3 是模拟器 Flint 的云端模拟系统,可在任何地方对使用 PhysioDesigner 创建的模型进行高性能模拟。
因此,PhysioDesigner 在两个不同的展台上进行了大量展示,并被视为一项重要应用。

10 月 11 日,冲绳科学技术研究所的北野宏明(Hiroaki Kitano)教授代表冲绳科学技术研究所举办了一场研讨会,介绍了包括 PhysioDesigner 在内的作为药物发现支持技术正在开发的整体应用。 演讲内容包括用于创建生物层次模型的 PhysioDesigner、模拟器 Flint、支持云计算的 Flint K3、用于创建亚细胞层次模型的 CellDesigner、用于在线共享通路模型的 iPathways+ 以及用于在线共享通路模型的 iPathways+。用于在线共享通路模型的 iPathways+,以及负责这些应用整体运作的 Garuda 联盟。有了这些技术,现在就可以模拟从分子到生物水平的整个系统代谢循环。 目前正在与美国食品药品管理局(FDA)、冲绳科学技术研究所、大阪大学新学术区、SBI(系统生物学研究所)和东京大学医院合作开展抗癌药物心脏毒性测试项目、PhysioDesigner 已成为该项目日益重要的组成部分。

此外,PhysioDesigner 所处理的模型今后会越来越大,因此需要 “K 计算机 “等高性能计算机来运行模拟。理化学研究所的展位上展示了 K 计算机,并已开始开发与 K 计算机兼容的模拟器 Flint 版本,用于 PhysioDesigner 所涉及的多层次模拟,有望为预测医学做出贡献。一旦完成,就可以在 K 计算机上使用 Flint 对 PhysioDesigner 上开发的任意模型进行大规模并行模拟。考虑到目前需要为 “K 计算机 “编写特殊程序,这是一项非常创新的想法和技术。从技术意义上讲,这将使 K 计算机的使用更加方便。
PhysioDesigner 继续在各个领域为综合生命科学的发展做出贡献和发展

大阪大学科学新学术区展台。

图 1.
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图 2.
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